2020-10-17
来源: drugdu
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2020年3月20日讯/生物谷bioon/---截至2020年10月,sars-cov-2导致了持续的大流行,全球报告的病例超过3500万,死亡人数超过100万。与sars-cov和a型流感病毒相比,在免疫反应方面将covid-19与sars区别开来的一个突出特征是sars-cov-2对i型干扰素(ifn)的诱导作用较差。值得注意的是,受损的ifn应答与covid-19疾病有关。但是,在sars-cov-2感染中低效ifn反应的分子机制尚不清楚。
东京大学医学科学研究所(imsut)的一个研究小组旨在鉴定决定sars-cov-2感染后免疫激活的病毒因子,并发现由sars-cov-2编码的基因orf3b是有效的ifn拮抗剂。
首席科学家,传染病控制部系统病毒学副教授kei sato说:“ covid-19患者的ifn反应不良可能是由于这种病毒产物orf3b的作用所致。”
尽管sars-cov感染会引起急性和严重的肺炎,但sars-cov-2感染可能是无症状的或导致类似流感的症状,例如发烧,咳嗽和疲劳。而且,与sars-cov和a型流感病毒感染相比,sars-cov-2感染的标志covid-19是对i型干扰素(ifn)的不良诱导。值得注意的是,受损的ifn应答与covid-19的严重程度有关。但是,在sars-cov-2感染中低效ifn反应的分子机制尚不清楚。
通过比较sars-cov-2编码基因和sars-cov的基因序列,研究小组发现sars-cov-2 orf3b的基因长度明显短于sars-cov orf3b的基因长度。
因为sars-cov的orf3b被称为是抗ifn的病毒拮抗剂,所以他们假设sars-cov-2和sars-cov之间orf3b基因长度的差异可能会改变其抗ifn活性,并可能进一步解释这一差异。这两种病毒感染的症状。
出乎意料的是,sars-cov-2 orf3b是一种比sars-cov orf3b更有效的ifn拮抗剂。系统发育分析和功能分析表明,蝙蝠和穿山甲的sars-cov-2相关病毒还编码具有较强抗ifn活性的较短的orf3b基因产物。
具有增强的抗ifn活性的天然sars-cov-2 orf3b变体的表征
此外,作者对大约17,000个sars-cov-2序列的分析确定了一个自然变异,其中重构了更长的orf3b阅读框。该变体比亲本sars-cov-2株的orf3b更有效地抑制ifn。
因此,继续监测病毒序列以查看在当前的大流行期间是否出现新的orf3b突变将很重要。(生物谷 bioon.com)
资讯出处:
原始出处:yoriyuki konno, izumi kimura, keiya uriu, masaya fukushi, takashi irie, yoshio koyanagi, daniel sauter, robert j. gifford, so nakagawa, kei sato. cell reports, 2020; 32 (12): 108185 doi: 10.1016/j.celrep.2020.108185